薛紫夜以为摩家村惨案，霍展白的师傅是罪魁祸首，但其实元一宫的宫主长无绝才是真正的幕后黑手，天山派是被嫁祸的。
长无绝一直在练一种魔功，同时挑起武林正派各派的猜忌，希望魔功练成后能一统江湖。欲速则不达，终于导致他走火入魔。
同时元一宫座下高手五明子、修罗场、三圣女，早就不满长无绝的心狠手辣，盯着宫主之位的人很多。
掌管修罗场的瞳，早就计划联合宫内其他高手准备造反，脱离长无绝的的掌控，自己做宫主。长无绝走火入魔，对于瞳来说，就是最好的时机。
此时，霍展白好不容易找到了，治疗沫儿的最后一味药材龙血珠。没想到瞳也来抢它，因为龙血珠是长无绝所练魔功的克星，将它化成粉末涂抹在刀上，只要伤到长无绝，他就必死无疑。
二人殊死决战，最终霍展白拿到了龙血珠，但都身受重伤昏迷。薛紫夜觉得瞳的眼睛，很像她小时候在摩家村认识的弟弟明介，便将他和霍展白一起带回药师谷疗伤。
薛紫夜在为瞳疗伤过程中，终于肯定了自己的猜测，也知道了他如今的身份是元一宫第一杀手。
她拼命想要让明介逃离那个魔窟，她发现长无绝在他的后脑勺，注入了三根钉子，封住了他儿时的所有记忆，便拼命想将三根钉子取出，帮他恢复记忆。
取钉子的过程，瞳十分痛苦，十分不相信薛子夜是真的想要救他，甚至也不相信，她给他讲的二人小时候在摩家村所发生的故事。
因为在元一宫魔鬼式杀人的训练中，他已经不相信任何人，甚至不相信自己的记忆。他认为他脑海中恍惚浮现的摩家村那一幕幕，不过是薛紫夜身为医者给他制造的幻觉。
他自己的那双眼睛，本来就是用来制造幻像杀人的，又怎么能相信别人给他制造的幻觉呢？
瞳伤好了，却利用薛紫夜的心软，从她手中骗走了霍展白用命才抢到的龙血珠，甚至重伤了薛紫夜，逃回了元一宫。
在他确定长无绝确实走火入魔后，立刻联络修罗场的手下以及盟友，准备利用龙血珠暗杀长无绝。
瞳不知道的是，长无绝走火入魔后，便立刻命令妙风出发去药师谷，请薛紫夜出诊元一宫替他治病。
此时，薛紫夜知道自己无法用这五味药治好沫儿的病，于是让霍展白带着自己的信物，去找她的师傅前药师谷谷主廖青染，寻求一线生机。
霍展白走时还和薛紫夜相约，下一次再一起酒，可那时薛紫夜和霍展白都不知道，那便是二人最后一次见面。
妙风带着十面回天令和百万诊金，甚至不惜自伤，也要请求薛紫夜前去元一宫治疗长无绝。
妙风本是楼兰王室一支，后国运衰弱，被迫流亡。路上遭遇盗匪，被魔教教王相救，自愿以命报答教王，被教王放入魔教修罗场搏杀。
修罗场里，多年严酷的淘汰和互相残杀中，500人里最终只剩下了瞳和妙风，二人的武功在伯仲之间，最终瞳成为了修罗场的领袖，而妙风便贴身保护长无绝，成了他最信任的人，武功绝技“沐春风”。
而薛紫夜之所以愿意跟妙风走，除了是不忍心妙风自伤以外，更重要的是趁为长无绝诊病的机会，她决心去元一宫带回明介。
而此时的同根本就不明白薛紫夜的苦心，一心只想杀了长无绝，所有阻挡他完成这个目标的人都要死。
所以当他得知，薛紫夜正在赶来为长无绝治病的路上，他立刻派了修罗场里的八名的高手前去杀她和妙风。
瞳很清楚妙风的能力，所以他对手下的原话是：就算杀不了妙风，也要尽力拖住他，为他杀长无绝争取时间，同时薛紫夜必须死。
妙风和八大高手对上，占不了便宜，加上在去元一宫的路上，薛紫夜寒症发作，妙风一直为她输送内力，消耗了很多真气。
在他重伤了八名高手中的七名时，也已经深受重伤，薛紫夜奄奄一息下，竟然冒险用自己救人的银针，暗算了另外一名高手，妙风才有机会将其击杀。
去元一宫途中，妙风感动于薛紫夜的善良和坚韧，最终爱上了薛紫夜。等他们二人赶到元一宫时，瞳已经中了七星海棠之毒。
原来妙水背叛了和瞳的联盟，“长无绝”和瞳决斗，瞳以为真的用龙血珠伤了“长无绝”。只可惜眼前的“长无绝”，不过是五名子之一的明力假扮的。
明力身亡，真正的长无绝现身，瞳也身中七星海棠之毒命不久矣，被关在元一宫地牢，由妙水看守。
七星海棠是百年来从未有人可以解的剧毒，二十年前，药师谷的临夏谷主苦苦思索一月，依旧无法解开这种毒，最终因为神思枯竭呕血而亡。
薛紫夜知道，临夏谷主临死前已经将七星海棠的解毒之法写下了。并不是这毒解不了，是因为解毒的方法是以命换命，将对方的毒转移到自己的身上。
薛紫夜要做第一个能解七星海棠之毒的人，换言之，她要用自己的命去换瞳的命。
妙水一直想坐收渔翁之利，薛紫夜用去刺杀长无绝的条件换妙水让她去地牢见瞳一面。此时的瞳终于相信了，薛紫夜就是他小时候认下的紫夜姐姐。
已经近乎绝望的瞳，希望薛紫夜赶紧逃离元一宫，不要管他。可他不知道的是，在薛紫夜临走之前，她已经把他身上的七星海棠之毒，转移到了自己身上。
薛紫夜果然依照诺言去刺杀了长无绝，一直在身旁的妙风想要阻止却已经来不及了。
长无绝最终气绝身亡，但是薛紫夜也深受重伤，不知道薛紫夜已身中七星海棠之毒的妙风，不顾宫中内乱，一心只想将薛紫夜带回药师谷医治。
瞳被修罗场的手下趁乱救出，立刻斩杀了妙水，也在四处寻找薛紫夜的踪迹。
同时，得知元一宫内乱的剑顶阁八剑，也想趁着元一宫力量最弱的时候，将其消灭。
霍展白集齐剑顶阁的几大高手，带队前往元一宫的时候，恰巧遇到了“遇神杀神，遇佛杀佛”，不顾一切要带薛紫夜回到药师谷的妙风。
为了尽快消灭元一宫，霍展白决定“抓大放小”，不和妙风纠缠，霍展白和薛紫夜就这么遗憾错过了。
原来这一场千里的跋涉，最终不过是来做最后一次甚至无法相见的告别。
瞳迅速归整了元一宫的高手，对抗剑顶阁八剑，虽然元一宫元气大伤，但是剑顶阁也出了叛徒，八剑的威力无法发挥到极致。
因为薛紫夜的原因，瞳不想和霍展白为敌，霍展白也知道，此时已经过了除掉元一宫的最好时机。
二人谈判，只要二人分别为正邪两派之首，双方便互不侵犯。自此，瞳和霍展白分别掌管黑白两道。
妙风以为自己可以救回薛紫夜，但其实薛紫夜早在他遇到霍展白的时候，就已经自杀死了。原著里这样写道：
“她中了七星海棠的毒，七日后便会丧失神志，我想她是不愿意自己有这样一个收梢。”女医者发出了一声叹息，走过来俯身查看着伤口，“她一定是一个极骄傲的女子。不过你也别难过——这一针直刺廉泉，极准又极深，她走的时候必然没吃太多的苦。”
最终，妙风将薛紫夜的遗体送回了药师谷。廖青染也回了药师谷重新做回谷主，妙风便留在了药师谷，拜她为师。
几年后，瞳和霍展白去药师谷祭奠薛紫夜，妙风已经成为了药师谷新一任谷主，三人共同思念着薛紫夜。